精工致善丨熱圖繪制
什么是熱圖？熱圖是對實驗數(shù)據(jù)分布情況進行分析的直觀可視化方法，可以用來進行實驗數(shù)據(jù)的質量控制和差異數(shù)據(jù)的具像化展示，還可以對數(shù)據(jù)和樣品進行聚類，觀測樣品質量。
如何繪制熱圖？
1.進入在線分析軟件
2.上傳數(shù)據(jù)
數(shù)據(jù)類型選擇濃度；數(shù)據(jù)格式選擇樣品在每一列（未配對），可根據(jù)實驗數(shù)據(jù)實際情況選擇樣品在每一行或是每一列、配對或未配對實驗；選擇上傳的文件，提交即可。
2.1上傳文件格式說明
①有樣本名和樣本分組信息，文件格式需為制表符分割的TXT文件或逗號分割的CSV文件。
②靶標中不能有希臘字母α、β等，用alpha、beta等替換。
示例：
2.2檢查數(shù)據(jù)格式
檢查數(shù)據(jù)格式，是否有非數(shù)值數(shù)據(jù)、缺失值或其它特殊字符和標點符號，默認將缺失值及零值替換為其對應變量的最小正值的1/5。
3.數(shù)據(jù)處理
4.選擇分析項目
5.參數(shù)設置
參數(shù)分別選擇原始數(shù)據(jù)、自動標準化特征、Euclidean距離測量方式、ward聚類方法（可根據(jù)自己實際情況調整）。點擊提交。
6.圖形解讀
圖中每個每個彩色單元格代表一個代謝物的濃度值。紅色代表高于均值，顏色越深，值越大，藍色代表低于平均值，顏色越深，值越小。上方的樹狀圖是將數(shù)據(jù)進行聚類分析，本質上利用的是多組值間兩兩的差異程度或者相似程度（比如歐式距離、相關系數(shù)等）作為依據(jù)，對多組值進行層級聚類，以最終得到樣本間聚類的遠近關系。
7.繪圖平臺
https://www.metaboanalyst.ca/
MetaboAnalyst是一個代謝組學數(shù)據(jù)分析的綜合平臺,當前的MetaboAnalyst (V5.0)支持原始MS光譜處理、綜合數(shù)據(jù)歸一化、統(tǒng)計分析、功能分析、薈萃分析以及與其他組學數(shù)據(jù)的綜合分析。
