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干貨分享丨代謝組學(xué)問題集錦之基礎(chǔ)篇

關(guān)于代謝組學(xué)你了解多少呢?小編最近發(fā)現(xiàn)有好多“新科研人”其實都是摸著石頭過河,并且網(wǎng)上系統(tǒng)性介紹代謝組學(xué)的內(nèi)容比較少。博萊克科技作為一家專業(yè)的代謝組學(xué)檢測公司,整理了大家的一系列疑問,下面就跟著小編一起來學(xué)習(xí)吧!


Q1

什么是代謝?

代謝(metabolism)是生命活動中所有(生物)化學(xué)變化的總稱,代謝活動是生命活動的本質(zhì)特征和物質(zhì)基礎(chǔ)。

Q2

什么是代謝物?

代謝物(metabolite)亦稱中間代謝物,是指生命體內(nèi)參與代謝過程的小分子有機化合物,通常指相對分子質(zhì)量小于1000 的氨基酸、脂肪酸、膽汁酸、維生素等內(nèi)源性物質(zhì),生物大分子不包括在內(nèi)。

Q3

什么是代謝組?

代謝組是指生物體內(nèi)源性代謝物質(zhì)的動態(tài)整體。代謝組對應(yīng)兩個英文單詞,分別是metabonome和metabolome,他們的區(qū)別和使用參見代謝組學(xué)部分的回答。

Q4

什么是代謝組學(xué)?

代謝組學(xué)是繼基因組和蛋白質(zhì)組學(xué)之后發(fā)展的新興學(xué)科,1999年英國帝國理工大學(xué)的Jeremy Nicholson等首次提出了代謝組學(xué)(metabonomics)的概念并將其定義為:“定量的描述內(nèi)源性代謝物整體隨時間對外界刺激而產(chǎn)生的變化”,這標志著代謝組學(xué)這門新興學(xué)科的誕生,Nicholson教授作為本學(xué)科的奠基人被譽為“代謝組學(xué)之父”。


德國馬普所的Oliver Fiehn等在2000年時也提出了代謝組學(xué)(metabolomics)的概念,將其定位為一個靜態(tài)的過程,“全面、定量分析生物體系中所有代謝物”。


目前對代謝組學(xué)的定義實際上綜合了metabonomics和meatbolomics兩個概念,把代謝組學(xué)看成是一個動態(tài)變化的代謝物組成系統(tǒng),研究對象既包括了機體所有代謝物,也包括對各種代謝調(diào)控因素的研究。metabonomics和metabolomics盡管在字面和概念上存在些許差異,但二者在實際工作中是通用的,沒有特別的區(qū)分。

Q5

什么是代謝表型?

基因和環(huán)境相互作用決定人體特征,人體特征即表型。代謝表型(metabolic phenotype)指不同個體中小分子代謝物的定量組成及變化規(guī)律,研究基因與環(huán)境因素相互作用而影響表型形成的原理機制,尋找健康特征及疾病發(fā)生發(fā)展的表型組規(guī)律,為生物醫(yī)學(xué)研究及應(yīng)用提供新突破口。

Q6

為什么要研究代謝組學(xué)?

首先,對生物體系而言,基因、轉(zhuǎn)錄子和蛋白質(zhì)的存在為某生物學(xué)事件或過程的發(fā)生奠定了物質(zhì)基礎(chǔ),但這個事件或過程有可能不發(fā)生;而代謝物的存在反映生命過程中已經(jīng)發(fā)生了的生物化學(xué)反應(yīng),其變化正是對該生物事件或過程的反映。代謝組處于基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和蛋白質(zhì)作用網(wǎng)絡(luò)的下游,所提供的是生物學(xué)的終端信息。


其次,絕大多數(shù)生物由宿主和與之共進化而共生的客體共同組成,是所謂的超級生物體。研究人體需要對人本身、菌群及其相互作用等在系統(tǒng)水平對所發(fā)生的生物事件進行整體性認識。僅僅研究宿主本身最多只能認識正常人體的一小部分。

Q7

 代謝組學(xué)的研究對象是什么?

可以是細胞、細菌、動物的體液和組織、植物的組織等,即可以是局部,也可以是生物機體整體。譬如,尿液和血液代謝組包含了人體內(nèi)每一個細胞的代謝信息(包括宿主和菌群),也包含了宿主和菌群代謝活動的相互作用。

Q8

代謝組學(xué)的研究領(lǐng)域有哪些?

涉及基礎(chǔ)生命科學(xué)、藥物研發(fā)、疾病生理、營養(yǎng)與植物藥學(xué)、環(huán)境科學(xué)等諸多領(lǐng)域。

Q9

代謝組學(xué)的檢測技術(shù)有哪些?

單一工具難以滿足對代謝物絕對定性和絕對定量的要求,主要依賴分析化學(xué)中的各種“譜”學(xué)技術(shù),包括磁共振波譜、質(zhì)譜、色譜、紅外和拉曼光譜、紫外-可見光譜等及其聯(lián)用方法。

Q10

什么是脂質(zhì)組?

脂質(zhì)組(lipidome)是代謝組的一個重要子集,主要研究包括脂肪酰、甘油脂、甘油磷脂、鞘脂、固醇脂質(zhì)、異戊烯醇脂、糖脂和聚酮化合物這八類脂質(zhì)在生物系統(tǒng)中的分布。

END

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